Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GOLGA4Q13439 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GOLGA4Q13439 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GOLGA4Q13439 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA4Q13439 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA4Q13439 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA4Q13439 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA4Q13439 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA4Q13439 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA4Q13439 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA4Q13439 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA4Q13439 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA4Q13439 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA4Q13439 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA4Q13439 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA4Q13439 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA4Q13439 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA4Q13439 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA4Q13439 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA4Q13439 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA4Q13439 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA4Q13439 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA4Q13439 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA4Q13439 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA4Q13439 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA4Q13439 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
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