Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGCGQ13326 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGCGQ13326 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGCGQ13326 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SGCGQ13326 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SGCGQ13326 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SGCGQ13326 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SGCGQ13326 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SGCGQ13326 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SGCGQ13326 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SGCGQ13326 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGCGQ13326 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGCGQ13326 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGCGQ13326 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGCGQ13326 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGCGQ13326 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGCGQ13326 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGCGQ13326 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGCGQ13326 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGCGQ13326 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGCGQ13326 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGCGQ13326 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGCGQ13326 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGCGQ13326 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGCGQ13326 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SGCGQ13326 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGCGQ13326 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SGCGQ13326 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SGCGQ13326 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SGCGQ13326 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SGCGQ13326 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SGCGQ13326 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SGCGQ13326 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SGCGQ13326 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SGCGQ13326 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SGCGQ13326 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SGCGQ13326 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGCGQ13326 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGCGQ13326 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGCGQ13326 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGCGQ13326 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SGCGQ13326 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SGCGQ13326 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGCGQ13326 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SGCGQ13326 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGCGQ13326 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGCGQ13326 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGCGQ13326 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGCGQ13326 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGCGQ13326 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGCGQ13326 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SGCGQ13326 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGCGQ13326 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGCGQ13326 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGCGQ13326 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGCGQ13326 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGCGQ13326 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGCGQ13326 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGCGQ13326 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGCGQ13326 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGCGQ13326 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SGCGQ13326 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGCGQ13326 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGCGQ13326 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGCGQ13326 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGCGQ13326 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGCGQ13326 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGCGQ13326 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGCGQ13326 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGCGQ13326 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGCGQ13326 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGCGQ13326 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGCGQ13326 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGCGQ13326 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGCGQ13326 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGCGQ13326 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGCGQ13326 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGCGQ13326 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGCGQ13326 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGCGQ13326 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGCGQ13326 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGCGQ13326 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGCGQ13326 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGCGQ13326 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGCGQ13326 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGCGQ13326 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGCGQ13326 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGCGQ13326 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGCGQ13326 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGCGQ13326 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGCGQ13326 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGCGQ13326 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGCGQ13326 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGCGQ13326 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGCGQ13326 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGCGQ13326 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGCGQ13326 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGCGQ13326 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGCGQ13326 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGCGQ13326 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
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