Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
TRDNQ13061 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRDNQ13061 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRDNQ13061 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRDNQ13061 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRDNQ13061 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRDNQ13061 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRDNQ13061 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TRDNQ13061 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TRDNQ13061 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TRDNQ13061 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRDNQ13061 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRDNQ13061 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRDNQ13061 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRDNQ13061 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRDNQ13061 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRDNQ13061 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRDNQ13061 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
TRDNQ13061 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRDNQ13061 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
TRDNQ13061 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRDNQ13061 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRDNQ13061 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRDNQ13061 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRDNQ13061 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRDNQ13061 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRDNQ13061 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRDNQ13061 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRDNQ13061 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRDNQ13061 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRDNQ13061 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRDNQ13061 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRDNQ13061 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRDNQ13061 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRDNQ13061 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRDNQ13061 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRDNQ13061 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRDNQ13061 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TRDNQ13061 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.62
TRDNQ13061 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRDNQ13061 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
TRDNQ13061 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRDNQ13061 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRDNQ13061 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRDNQ13061 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRDNQ13061 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRDNQ13061 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRDNQ13061 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRDNQ13061 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
TRDNQ13061 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRDNQ13061 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TRDNQ13061 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
TRDNQ13061 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRDNQ13061 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TRDNQ13061 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRDNQ13061 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRDNQ13061 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRDNQ13061 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRDNQ13061 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRDNQ13061 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
TRDNQ13061 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
TRDNQ13061 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TRDNQ13061 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRDNQ13061 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TRDNQ13061 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
TRDNQ13061 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRDNQ13061 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRDNQ13061 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
TRDNQ13061 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TRDNQ13061 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TRDNQ13061 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TRDNQ13061 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TRDNQ13061 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TRDNQ13061 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TRDNQ13061 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
TRDNQ13061 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRDNQ13061 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRDNQ13061 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRDNQ13061 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRDNQ13061 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRDNQ13061 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
TRDNQ13061 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TRDNQ13061 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TRDNQ13061 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TRDNQ13061 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
TRDNQ13061 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TRDNQ13061 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TRDNQ13061 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TRDNQ13061 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
TRDNQ13061 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TRDNQ13061 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TRDNQ13061 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TRDNQ13061 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TRDNQ13061 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TRDNQ13061 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRDNQ13061 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRDNQ13061 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRDNQ13061 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRDNQ13061 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRDNQ13061 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
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