Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPRL3Q12980 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPRL3Q12980 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPRL3Q12980 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPRL3Q12980 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPRL3Q12980 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPRL3Q12980 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPRL3Q12980 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPRL3Q12980 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPRL3Q12980 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPRL3Q12980 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPRL3Q12980 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPRL3Q12980 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPRL3Q12980 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPRL3Q12980 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPRL3Q12980 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPRL3Q12980 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPRL3Q12980 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPRL3Q12980 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPRL3Q12980 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPRL3Q12980 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPRL3Q12980 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPRL3Q12980 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPRL3Q12980 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPRL3Q12980 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPRL3Q12980 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPRL3Q12980 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPRL3Q12980 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPRL3Q12980 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPRL3Q12980 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPRL3Q12980 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPRL3Q12980 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPRL3Q12980 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPRL3Q12980 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPRL3Q12980 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPRL3Q12980 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPRL3Q12980 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPRL3Q12980 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPRL3Q12980 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPRL3Q12980 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPRL3Q12980 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NPRL3Q12980 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPRL3Q12980 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPRL3Q12980 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPRL3Q12980 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPRL3Q12980 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPRL3Q12980 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPRL3Q12980 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPRL3Q12980 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPRL3Q12980 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPRL3Q12980 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NPRL3Q12980 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPRL3Q12980 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPRL3Q12980 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPRL3Q12980 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NPRL3Q12980 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPRL3Q12980 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPRL3Q12980 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPRL3Q12980 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPRL3Q12980 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPRL3Q12980 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPRL3Q12980 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPRL3Q12980 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPRL3Q12980 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPRL3Q12980 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPRL3Q12980 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPRL3Q12980 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPRL3Q12980 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPRL3Q12980 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPRL3Q12980 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPRL3Q12980 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPRL3Q12980 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPRL3Q12980 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPRL3Q12980 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPRL3Q12980 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPRL3Q12980 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPRL3Q12980 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPRL3Q12980 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPRL3Q12980 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPRL3Q12980 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPRL3Q12980 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPRL3Q12980 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPRL3Q12980 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPRL3Q12980 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPRL3Q12980 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPRL3Q12980 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPRL3Q12980 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPRL3Q12980 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPRL3Q12980 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPRL3Q12980 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPRL3Q12980 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPRL3Q12980 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPRL3Q12980 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPRL3Q12980 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NPRL3Q12980 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPRL3Q12980 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPRL3Q12980 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPRL3Q12980 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPRL3Q12980 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPRL3Q12980 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
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