Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COX10Q12887 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COX10Q12887 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COX10Q12887 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COX10Q12887 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COX10Q12887 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COX10Q12887 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COX10Q12887 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COX10Q12887 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COX10Q12887 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COX10Q12887 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COX10Q12887 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COX10Q12887 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COX10Q12887 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COX10Q12887 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COX10Q12887 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COX10Q12887 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COX10Q12887 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COX10Q12887 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COX10Q12887 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COX10Q12887 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COX10Q12887 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COX10Q12887 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COX10Q12887 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COX10Q12887 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COX10Q12887 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COX10Q12887 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COX10Q12887 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COX10Q12887 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COX10Q12887 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COX10Q12887 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COX10Q12887 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COX10Q12887 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COX10Q12887 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COX10Q12887 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COX10Q12887 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COX10Q12887 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COX10Q12887 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COX10Q12887 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COX10Q12887 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COX10Q12887 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COX10Q12887 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COX10Q12887 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COX10Q12887 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COX10Q12887 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COX10Q12887 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COX10Q12887 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COX10Q12887 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COX10Q12887 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COX10Q12887 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COX10Q12887 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COX10Q12887 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COX10Q12887 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COX10Q12887 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COX10Q12887 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COX10Q12887 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COX10Q12887 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COX10Q12887 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COX10Q12887 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COX10Q12887 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COX10Q12887 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COX10Q12887 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COX10Q12887 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COX10Q12887 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COX10Q12887 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX10Q12887 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX10Q12887 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX10Q12887 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX10Q12887 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX10Q12887 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX10Q12887 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX10Q12887 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX10Q12887 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COX10Q12887 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX10Q12887 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX10Q12887 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX10Q12887 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX10Q12887 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COX10Q12887 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COX10Q12887 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COX10Q12887 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COX10Q12887 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COX10Q12887 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COX10Q12887 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COX10Q12887 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COX10Q12887 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX10Q12887 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX10Q12887 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COX10Q12887 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COX10Q12887 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COX10Q12887 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COX10Q12887 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COX10Q12887 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COX10Q12887 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COX10Q12887 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COX10Q12887 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX10Q12887 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX10Q12887 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX10Q12887 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX10Q12887 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148 ms