Protein–RNA interactions for Protein: Q08174

PCDH1, Protocadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH1Q08174 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDH1Q08174 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDH1Q08174 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDH1Q08174 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDH1Q08174 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDH1Q08174 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDH1Q08174 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDH1Q08174 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDH1Q08174 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDH1Q08174 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDH1Q08174 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDH1Q08174 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDH1Q08174 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDH1Q08174 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDH1Q08174 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDH1Q08174 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDH1Q08174 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDH1Q08174 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH1Q08174 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH1Q08174 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH1Q08174 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDH1Q08174 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDH1Q08174 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDH1Q08174 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDH1Q08174 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDH1Q08174 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDH1Q08174 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDH1Q08174 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDH1Q08174 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDH1Q08174 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDH1Q08174 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH1Q08174 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH1Q08174 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDH1Q08174 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDH1Q08174 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH1Q08174 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH1Q08174 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH1Q08174 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH1Q08174 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH1Q08174 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH1Q08174 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH1Q08174 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDH1Q08174 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDH1Q08174 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDH1Q08174 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDH1Q08174 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDH1Q08174 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDH1Q08174 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDH1Q08174 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDH1Q08174 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDH1Q08174 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDH1Q08174 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDH1Q08174 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDH1Q08174 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDH1Q08174 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDH1Q08174 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDH1Q08174 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDH1Q08174 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDH1Q08174 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDH1Q08174 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDH1Q08174 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDH1Q08174 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDH1Q08174 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDH1Q08174 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDH1Q08174 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDH1Q08174 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDH1Q08174 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDH1Q08174 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDH1Q08174 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDH1Q08174 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDH1Q08174 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDH1Q08174 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDH1Q08174 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDH1Q08174 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDH1Q08174 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDH1Q08174 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDH1Q08174 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDH1Q08174 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDH1Q08174 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCDH1Q08174 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDH1Q08174 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDH1Q08174 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDH1Q08174 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDH1Q08174 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDH1Q08174 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDH1Q08174 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDH1Q08174 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDH1Q08174 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDH1Q08174 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDH1Q08174 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDH1Q08174 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDH1Q08174 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDH1Q08174 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDH1Q08174 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDH1Q08174 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDH1Q08174 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDH1Q08174 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDH1Q08174 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDH1Q08174 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDH1Q08174 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms