Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFI35P80217 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFI35P80217 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFI35P80217 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFI35P80217 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
IFI35P80217 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFI35P80217 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFI35P80217 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IFI35P80217 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IFI35P80217 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFI35P80217 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IFI35P80217 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFI35P80217 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFI35P80217 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFI35P80217 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
IFI35P80217 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFI35P80217 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFI35P80217 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFI35P80217 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFI35P80217 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFI35P80217 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFI35P80217 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFI35P80217 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFI35P80217 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFI35P80217 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFI35P80217 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFI35P80217 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
IFI35P80217 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFI35P80217 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFI35P80217 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFI35P80217 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFI35P80217 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFI35P80217 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFI35P80217 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFI35P80217 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFI35P80217 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
IFI35P80217 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
IFI35P80217 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFI35P80217 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFI35P80217 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFI35P80217 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFI35P80217 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFI35P80217 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFI35P80217 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFI35P80217 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFI35P80217 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFI35P80217 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFI35P80217 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFI35P80217 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFI35P80217 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
IFI35P80217 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFI35P80217 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFI35P80217 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFI35P80217 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFI35P80217 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
IFI35P80217 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFI35P80217 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFI35P80217 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFI35P80217 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFI35P80217 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFI35P80217 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
IFI35P80217 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFI35P80217 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFI35P80217 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFI35P80217 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFI35P80217 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFI35P80217 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFI35P80217 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFI35P80217 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFI35P80217 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFI35P80217 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFI35P80217 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFI35P80217 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFI35P80217 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFI35P80217 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFI35P80217 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFI35P80217 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFI35P80217 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFI35P80217 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFI35P80217 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFI35P80217 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFI35P80217 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFI35P80217 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFI35P80217 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFI35P80217 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFI35P80217 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFI35P80217 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFI35P80217 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFI35P80217 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFI35P80217 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFI35P80217 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFI35P80217 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFI35P80217 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFI35P80217 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFI35P80217 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFI35P80217 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFI35P80217 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFI35P80217 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFI35P80217 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFI35P80217 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms