Protein–RNA interactions for Protein: P80162

CXCL6, C-X-C motif chemokine 6, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL6P80162 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL6P80162 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL6P80162 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL6P80162 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL6P80162 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL6P80162 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL6P80162 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL6P80162 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL6P80162 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL6P80162 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL6P80162 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL6P80162 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL6P80162 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL6P80162 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL6P80162 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL6P80162 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL6P80162 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL6P80162 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL6P80162 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL6P80162 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL6P80162 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL6P80162 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL6P80162 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL6P80162 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL6P80162 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL6P80162 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL6P80162 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL6P80162 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL6P80162 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL6P80162 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL6P80162 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL6P80162 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL6P80162 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL6P80162 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL6P80162 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL6P80162 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL6P80162 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL6P80162 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL6P80162 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL6P80162 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL6P80162 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL6P80162 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL6P80162 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL6P80162 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL6P80162 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL6P80162 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL6P80162 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL6P80162 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms