Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLDN10P78369 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLDN10P78369 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLDN10P78369 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLDN10P78369 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLDN10P78369 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLDN10P78369 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLDN10P78369 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLDN10P78369 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLDN10P78369 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLDN10P78369 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLDN10P78369 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLDN10P78369 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLDN10P78369 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLDN10P78369 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CLDN10P78369 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLDN10P78369 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLDN10P78369 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLDN10P78369 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLDN10P78369 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLDN10P78369 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLDN10P78369 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLDN10P78369 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLDN10P78369 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CLDN10P78369 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLDN10P78369 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLDN10P78369 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLDN10P78369 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLDN10P78369 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLDN10P78369 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLDN10P78369 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLDN10P78369 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLDN10P78369 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLDN10P78369 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLDN10P78369 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLDN10P78369 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLDN10P78369 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLDN10P78369 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLDN10P78369 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLDN10P78369 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLDN10P78369 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLDN10P78369 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLDN10P78369 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CLDN10P78369 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLDN10P78369 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLDN10P78369 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLDN10P78369 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLDN10P78369 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLDN10P78369 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLDN10P78369 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLDN10P78369 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLDN10P78369 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CLDN10P78369 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLDN10P78369 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CLDN10P78369 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLDN10P78369 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLDN10P78369 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLDN10P78369 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLDN10P78369 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CLDN10P78369 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLDN10P78369 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLDN10P78369 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLDN10P78369 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLDN10P78369 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLDN10P78369 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLDN10P78369 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLDN10P78369 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLDN10P78369 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CLDN10P78369 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLDN10P78369 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLDN10P78369 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLDN10P78369 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLDN10P78369 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLDN10P78369 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLDN10P78369 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLDN10P78369 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLDN10P78369 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLDN10P78369 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CLDN10P78369 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLDN10P78369 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLDN10P78369 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CLDN10P78369 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLDN10P78369 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLDN10P78369 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CLDN10P78369 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLDN10P78369 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLDN10P78369 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLDN10P78369 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLDN10P78369 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CLDN10P78369 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLDN10P78369 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLDN10P78369 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLDN10P78369 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLDN10P78369 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLDN10P78369 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLDN10P78369 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLDN10P78369 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLDN10P78369 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLDN10P78369 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLDN10P78369 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms