Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBA4AP68366 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBA4AP68366 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBA4AP68366 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBA4AP68366 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBA4AP68366 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBA4AP68366 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBA4AP68366 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBA4AP68366 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBA4AP68366 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBA4AP68366 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBA4AP68366 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBA4AP68366 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBA4AP68366 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBA4AP68366 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBA4AP68366 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBA4AP68366 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBA4AP68366 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBA4AP68366 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBA4AP68366 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBA4AP68366 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBA4AP68366 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBA4AP68366 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBA4AP68366 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBA4AP68366 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBA4AP68366 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBA4AP68366 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBA4AP68366 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBA4AP68366 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBA4AP68366 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBA4AP68366 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBA4AP68366 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBA4AP68366 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBA4AP68366 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBA4AP68366 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBA4AP68366 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBA4AP68366 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBA4AP68366 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBA4AP68366 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBA4AP68366 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBA4AP68366 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBA4AP68366 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBA4AP68366 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBA4AP68366 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBA4AP68366 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBA4AP68366 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBA4AP68366 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBA4AP68366 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBA4AP68366 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBA4AP68366 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBA4AP68366 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBA4AP68366 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBA4AP68366 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBA4AP68366 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBA4AP68366 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBA4AP68366 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBA4AP68366 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBA4AP68366 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBA4AP68366 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBA4AP68366 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBA4AP68366 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBA4AP68366 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBA4AP68366 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBA4AP68366 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBA4AP68366 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBA4AP68366 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBA4AP68366 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBA4AP68366 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBA4AP68366 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBA4AP68366 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBA4AP68366 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBA4AP68366 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBA4AP68366 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBA4AP68366 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBA4AP68366 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBA4AP68366 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBA4AP68366 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBA4AP68366 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBA4AP68366 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBA4AP68366 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBA4AP68366 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBA4AP68366 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBA4AP68366 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBA4AP68366 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBA4AP68366 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TUBA4AP68366 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TUBA4AP68366 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBA4AP68366 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBA4AP68366 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBA4AP68366 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBA4AP68366 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBA4AP68366 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBA4AP68366 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBA4AP68366 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBA4AP68366 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBA4AP68366 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBA4AP68366 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBA4AP68366 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBA4AP68366 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBA4AP68366 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms