Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNNC1P63316 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TNNC1P63316 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNNC1P63316 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNC1P63316 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNC1P63316 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNC1P63316 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNC1P63316 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNC1P63316 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNC1P63316 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNNC1P63316 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNNC1P63316 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNC1P63316 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNC1P63316 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNC1P63316 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNC1P63316 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNC1P63316 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNC1P63316 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNC1P63316 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNC1P63316 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNC1P63316 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNC1P63316 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNC1P63316 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNC1P63316 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TNNC1P63316 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNC1P63316 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNC1P63316 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNC1P63316 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNC1P63316 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNC1P63316 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNC1P63316 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNC1P63316 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNC1P63316 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNC1P63316 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNC1P63316 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNC1P63316 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNC1P63316 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNC1P63316 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNC1P63316 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNC1P63316 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNC1P63316 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNC1P63316 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNC1P63316 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNNC1P63316 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNC1P63316 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNC1P63316 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNC1P63316 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TNNC1P63316 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TNNC1P63316 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNC1P63316 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNC1P63316 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNC1P63316 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNC1P63316 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNNC1P63316 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNNC1P63316 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNNC1P63316 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNNC1P63316 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNNC1P63316 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNNC1P63316 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNNC1P63316 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNNC1P63316 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNNC1P63316 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TNNC1P63316 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TNNC1P63316 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TNNC1P63316 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNNC1P63316 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNNC1P63316 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNNC1P63316 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNNC1P63316 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNNC1P63316 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNNC1P63316 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNNC1P63316 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNNC1P63316 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNNC1P63316 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNNC1P63316 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNC1P63316 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNC1P63316 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNC1P63316 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNNC1P63316 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNNC1P63316 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNNC1P63316 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNNC1P63316 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNNC1P63316 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNNC1P63316 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNNC1P63316 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNNC1P63316 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNNC1P63316 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNNC1P63316 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNNC1P63316 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNNC1P63316 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNNC1P63316 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNC1P63316 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNC1P63316 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNC1P63316 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNC1P63316 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNNC1P63316 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNNC1P63316 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNNC1P63316 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNC1P63316 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNC1P63316 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms