Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNRPD3P62318 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNRPD3P62318 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNRPD3P62318 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPD3P62318 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPD3P62318 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPD3P62318 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPD3P62318 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPD3P62318 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNRPD3P62318 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNRPD3P62318 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SNRPD3P62318 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SNRPD3P62318 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNRPD3P62318 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNRPD3P62318 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNRPD3P62318 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNRPD3P62318 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNRPD3P62318 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNRPD3P62318 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNRPD3P62318 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNRPD3P62318 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNRPD3P62318 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNRPD3P62318 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNRPD3P62318 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNRPD3P62318 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNRPD3P62318 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNRPD3P62318 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNRPD3P62318 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNRPD3P62318 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNRPD3P62318 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNRPD3P62318 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNRPD3P62318 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNRPD3P62318 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNRPD3P62318 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNRPD3P62318 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNRPD3P62318 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNRPD3P62318 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNRPD3P62318 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNRPD3P62318 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNRPD3P62318 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNRPD3P62318 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNRPD3P62318 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNRPD3P62318 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNRPD3P62318 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SNRPD3P62318 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNRPD3P62318 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SNRPD3P62318 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNRPD3P62318 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNRPD3P62318 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNRPD3P62318 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNRPD3P62318 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNRPD3P62318 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNRPD3P62318 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNRPD3P62318 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPD3P62318 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPD3P62318 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPD3P62318 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPD3P62318 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPD3P62318 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPD3P62318 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPD3P62318 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPD3P62318 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNRPD3P62318 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SNRPD3P62318 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNRPD3P62318 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNRPD3P62318 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNRPD3P62318 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNRPD3P62318 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNRPD3P62318 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNRPD3P62318 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNRPD3P62318 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNRPD3P62318 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNRPD3P62318 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNRPD3P62318 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNRPD3P62318 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNRPD3P62318 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNRPD3P62318 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNRPD3P62318 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNRPD3P62318 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNRPD3P62318 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNRPD3P62318 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNRPD3P62318 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPD3P62318 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPD3P62318 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPD3P62318 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPD3P62318 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPD3P62318 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNRPD3P62318 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNRPD3P62318 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNRPD3P62318 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNRPD3P62318 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNRPD3P62318 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNRPD3P62318 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNRPD3P62318 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNRPD3P62318 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNRPD3P62318 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNRPD3P62318 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNRPD3P62318 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNRPD3P62318 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNRPD3P62318 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms