Protein–RNA interactions for Protein: P62258

YWHAE, 14-3-3 protein epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YWHAEP62258 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
YWHAEP62258 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
YWHAEP62258 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
YWHAEP62258 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
YWHAEP62258 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
YWHAEP62258 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
YWHAEP62258 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
YWHAEP62258 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
YWHAEP62258 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
YWHAEP62258 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
YWHAEP62258 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
YWHAEP62258 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
YWHAEP62258 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
YWHAEP62258 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
YWHAEP62258 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
YWHAEP62258 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
YWHAEP62258 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
YWHAEP62258 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
YWHAEP62258 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
YWHAEP62258 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
YWHAEP62258 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
YWHAEP62258 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
YWHAEP62258 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
YWHAEP62258 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
YWHAEP62258 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
YWHAEP62258 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
YWHAEP62258 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
YWHAEP62258 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
YWHAEP62258 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
YWHAEP62258 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
YWHAEP62258 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
YWHAEP62258 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
YWHAEP62258 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
YWHAEP62258 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
YWHAEP62258 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
YWHAEP62258 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
YWHAEP62258 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
YWHAEP62258 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
YWHAEP62258 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
YWHAEP62258 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
YWHAEP62258 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
YWHAEP62258 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
YWHAEP62258 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
YWHAEP62258 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
YWHAEP62258 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
YWHAEP62258 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
YWHAEP62258 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
YWHAEP62258 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
YWHAEP62258 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
YWHAEP62258 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
YWHAEP62258 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
YWHAEP62258 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
YWHAEP62258 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
YWHAEP62258 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
YWHAEP62258 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
YWHAEP62258 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
YWHAEP62258 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
YWHAEP62258 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
YWHAEP62258 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
YWHAEP62258 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
YWHAEP62258 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
YWHAEP62258 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
YWHAEP62258 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
YWHAEP62258 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
YWHAEP62258 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
YWHAEP62258 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
YWHAEP62258 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
YWHAEP62258 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
YWHAEP62258 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
YWHAEP62258 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
YWHAEP62258 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
YWHAEP62258 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
YWHAEP62258 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
YWHAEP62258 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
YWHAEP62258 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
YWHAEP62258 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
YWHAEP62258 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
YWHAEP62258 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
YWHAEP62258 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
YWHAEP62258 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
YWHAEP62258 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
YWHAEP62258 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
YWHAEP62258 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
YWHAEP62258 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
YWHAEP62258 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
YWHAEP62258 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
YWHAEP62258 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
YWHAEP62258 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
YWHAEP62258 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
YWHAEP62258 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
YWHAEP62258 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
YWHAEP62258 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
YWHAEP62258 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
YWHAEP62258 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
YWHAEP62258 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
YWHAEP62258 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
YWHAEP62258 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
YWHAEP62258 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
YWHAEP62258 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
YWHAEP62258 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms