Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VBP1P61758 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VBP1P61758 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VBP1P61758 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VBP1P61758 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VBP1P61758 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VBP1P61758 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VBP1P61758 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VBP1P61758 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VBP1P61758 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VBP1P61758 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VBP1P61758 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VBP1P61758 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VBP1P61758 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VBP1P61758 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VBP1P61758 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VBP1P61758 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VBP1P61758 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VBP1P61758 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VBP1P61758 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VBP1P61758 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VBP1P61758 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VBP1P61758 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VBP1P61758 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VBP1P61758 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VBP1P61758 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VBP1P61758 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VBP1P61758 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VBP1P61758 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VBP1P61758 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VBP1P61758 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VBP1P61758 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VBP1P61758 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VBP1P61758 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VBP1P61758 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VBP1P61758 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VBP1P61758 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VBP1P61758 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VBP1P61758 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VBP1P61758 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VBP1P61758 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VBP1P61758 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VBP1P61758 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VBP1P61758 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VBP1P61758 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VBP1P61758 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VBP1P61758 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VBP1P61758 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VBP1P61758 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VBP1P61758 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VBP1P61758 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VBP1P61758 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VBP1P61758 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VBP1P61758 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VBP1P61758 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VBP1P61758 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VBP1P61758 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VBP1P61758 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VBP1P61758 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VBP1P61758 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VBP1P61758 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VBP1P61758 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VBP1P61758 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VBP1P61758 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VBP1P61758 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VBP1P61758 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VBP1P61758 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VBP1P61758 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VBP1P61758 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VBP1P61758 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VBP1P61758 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VBP1P61758 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VBP1P61758 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VBP1P61758 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VBP1P61758 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VBP1P61758 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VBP1P61758 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VBP1P61758 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VBP1P61758 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VBP1P61758 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VBP1P61758 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VBP1P61758 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VBP1P61758 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VBP1P61758 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VBP1P61758 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VBP1P61758 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VBP1P61758 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VBP1P61758 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VBP1P61758 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VBP1P61758 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VBP1P61758 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VBP1P61758 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VBP1P61758 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VBP1P61758 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VBP1P61758 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VBP1P61758 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VBP1P61758 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VBP1P61758 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VBP1P61758 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VBP1P61758 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms