Protein–RNA interactions for Protein: P61289

PSME3, Proteasome activator complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3P61289 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSME3P61289 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSME3P61289 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSME3P61289 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSME3P61289 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSME3P61289 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSME3P61289 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSME3P61289 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PSME3P61289 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSME3P61289 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSME3P61289 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSME3P61289 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSME3P61289 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSME3P61289 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME3P61289 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME3P61289 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME3P61289 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME3P61289 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME3P61289 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME3P61289 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME3P61289 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME3P61289 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME3P61289 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME3P61289 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME3P61289 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME3P61289 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME3P61289 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME3P61289 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME3P61289 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME3P61289 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME3P61289 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME3P61289 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME3P61289 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME3P61289 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME3P61289 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME3P61289 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME3P61289 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME3P61289 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME3P61289 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME3P61289 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME3P61289 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME3P61289 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME3P61289 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME3P61289 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME3P61289 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME3P61289 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME3P61289 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME3P61289 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME3P61289 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME3P61289 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME3P61289 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME3P61289 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSME3P61289 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME3P61289 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME3P61289 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME3P61289 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME3P61289 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME3P61289 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME3P61289 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME3P61289 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME3P61289 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME3P61289 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME3P61289 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME3P61289 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME3P61289 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME3P61289 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME3P61289 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME3P61289 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME3P61289 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME3P61289 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME3P61289 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PSME3P61289 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSME3P61289 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSME3P61289 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSME3P61289 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME3P61289 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME3P61289 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME3P61289 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME3P61289 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME3P61289 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME3P61289 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME3P61289 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME3P61289 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME3P61289 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSME3P61289 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSME3P61289 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PSME3P61289 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSME3P61289 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSME3P61289 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME3P61289 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSME3P61289 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSME3P61289 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PSME3P61289 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSME3P61289 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSME3P61289 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSME3P61289 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSME3P61289 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSME3P61289 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSME3P61289 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSME3P61289 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms