Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBE2MP61081 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2MP61081 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2MP61081 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2MP61081 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2MP61081 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2MP61081 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2MP61081 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2MP61081 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2MP61081 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2MP61081 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2MP61081 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2MP61081 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2MP61081 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2MP61081 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2MP61081 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2MP61081 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2MP61081 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2MP61081 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2MP61081 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2MP61081 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2MP61081 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2MP61081 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2MP61081 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2MP61081 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2MP61081 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2MP61081 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2MP61081 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2MP61081 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2MP61081 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2MP61081 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2MP61081 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2MP61081 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2MP61081 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2MP61081 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2MP61081 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2MP61081 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2MP61081 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2MP61081 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2MP61081 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2MP61081 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2MP61081 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2MP61081 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2MP61081 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2MP61081 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2MP61081 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2MP61081 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2MP61081 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2MP61081 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2MP61081 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2MP61081 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2MP61081 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2MP61081 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2MP61081 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2MP61081 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBE2MP61081 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2MP61081 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2MP61081 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2MP61081 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2MP61081 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2MP61081 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2MP61081 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2MP61081 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2MP61081 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2MP61081 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2MP61081 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2MP61081 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2MP61081 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2MP61081 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2MP61081 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2MP61081 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2MP61081 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2MP61081 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2MP61081 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2MP61081 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2MP61081 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2MP61081 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2MP61081 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2MP61081 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2MP61081 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2MP61081 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2MP61081 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2MP61081 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2MP61081 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2MP61081 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2MP61081 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2MP61081 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2MP61081 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2MP61081 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2MP61081 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE2MP61081 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE2MP61081 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2MP61081 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2MP61081 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2MP61081 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2MP61081 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2MP61081 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2MP61081 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2MP61081 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2MP61081 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms