Protein–RNA interactions for Protein: P59646

FXYD4, FXYD domain-containing ion transport regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD4P59646 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FXYD4P59646 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FXYD4P59646 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FXYD4P59646 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FXYD4P59646 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FXYD4P59646 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FXYD4P59646 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FXYD4P59646 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FXYD4P59646 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FXYD4P59646 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FXYD4P59646 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FXYD4P59646 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FXYD4P59646 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FXYD4P59646 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FXYD4P59646 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FXYD4P59646 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FXYD4P59646 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FXYD4P59646 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FXYD4P59646 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FXYD4P59646 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FXYD4P59646 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FXYD4P59646 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FXYD4P59646 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FXYD4P59646 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FXYD4P59646 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FXYD4P59646 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FXYD4P59646 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FXYD4P59646 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FXYD4P59646 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FXYD4P59646 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FXYD4P59646 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FXYD4P59646 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FXYD4P59646 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FXYD4P59646 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FXYD4P59646 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FXYD4P59646 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FXYD4P59646 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FXYD4P59646 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FXYD4P59646 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FXYD4P59646 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FXYD4P59646 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FXYD4P59646 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FXYD4P59646 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FXYD4P59646 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FXYD4P59646 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FXYD4P59646 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FXYD4P59646 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FXYD4P59646 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FXYD4P59646 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FXYD4P59646 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FXYD4P59646 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FXYD4P59646 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FXYD4P59646 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FXYD4P59646 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FXYD4P59646 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FXYD4P59646 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FXYD4P59646 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FXYD4P59646 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FXYD4P59646 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FXYD4P59646 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FXYD4P59646 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FXYD4P59646 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FXYD4P59646 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FXYD4P59646 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FXYD4P59646 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FXYD4P59646 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FXYD4P59646 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FXYD4P59646 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FXYD4P59646 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FXYD4P59646 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FXYD4P59646 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FXYD4P59646 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FXYD4P59646 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FXYD4P59646 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FXYD4P59646 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FXYD4P59646 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FXYD4P59646 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FXYD4P59646 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FXYD4P59646 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FXYD4P59646 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FXYD4P59646 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FXYD4P59646 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FXYD4P59646 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FXYD4P59646 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FXYD4P59646 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FXYD4P59646 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FXYD4P59646 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FXYD4P59646 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FXYD4P59646 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FXYD4P59646 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FXYD4P59646 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FXYD4P59646 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FXYD4P59646 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FXYD4P59646 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FXYD4P59646 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FXYD4P59646 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXYD4P59646 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXYD4P59646 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXYD4P59646 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FXYD4P59646 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms