Protein–RNA interactions for Protein: P55285

CDH6, Cadherin-6, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH6P55285 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDH6P55285 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDH6P55285 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDH6P55285 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDH6P55285 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDH6P55285 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDH6P55285 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDH6P55285 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDH6P55285 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CDH6P55285 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDH6P55285 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDH6P55285 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CDH6P55285 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDH6P55285 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH6P55285 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH6P55285 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH6P55285 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH6P55285 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH6P55285 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH6P55285 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH6P55285 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDH6P55285 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDH6P55285 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDH6P55285 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDH6P55285 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDH6P55285 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDH6P55285 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDH6P55285 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDH6P55285 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDH6P55285 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDH6P55285 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDH6P55285 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDH6P55285 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDH6P55285 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDH6P55285 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDH6P55285 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDH6P55285 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDH6P55285 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CDH6P55285 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDH6P55285 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDH6P55285 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDH6P55285 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDH6P55285 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDH6P55285 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDH6P55285 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDH6P55285 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDH6P55285 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDH6P55285 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDH6P55285 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDH6P55285 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDH6P55285 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDH6P55285 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDH6P55285 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDH6P55285 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDH6P55285 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDH6P55285 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CDH6P55285 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDH6P55285 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDH6P55285 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDH6P55285 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDH6P55285 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDH6P55285 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDH6P55285 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDH6P55285 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH6P55285 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH6P55285 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH6P55285 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH6P55285 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH6P55285 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDH6P55285 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDH6P55285 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDH6P55285 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDH6P55285 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDH6P55285 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDH6P55285 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDH6P55285 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDH6P55285 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDH6P55285 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDH6P55285 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDH6P55285 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDH6P55285 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDH6P55285 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDH6P55285 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CDH6P55285 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDH6P55285 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDH6P55285 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDH6P55285 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDH6P55285 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDH6P55285 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDH6P55285 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDH6P55285 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDH6P55285 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDH6P55285 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDH6P55285 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CDH6P55285 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDH6P55285 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDH6P55285 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDH6P55285 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH6P55285 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CDH6P55285 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms