Protein–RNA interactions for Protein: P55075

FGF8, Fibroblast growth factor 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF8P55075 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGF8P55075 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGF8P55075 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGF8P55075 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGF8P55075 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FGF8P55075 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGF8P55075 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGF8P55075 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGF8P55075 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGF8P55075 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGF8P55075 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGF8P55075 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGF8P55075 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGF8P55075 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGF8P55075 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGF8P55075 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGF8P55075 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGF8P55075 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGF8P55075 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGF8P55075 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGF8P55075 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGF8P55075 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGF8P55075 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGF8P55075 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGF8P55075 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGF8P55075 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGF8P55075 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGF8P55075 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FGF8P55075 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FGF8P55075 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FGF8P55075 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FGF8P55075 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FGF8P55075 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FGF8P55075 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FGF8P55075 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FGF8P55075 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FGF8P55075 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FGF8P55075 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FGF8P55075 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FGF8P55075 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FGF8P55075 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGF8P55075 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGF8P55075 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGF8P55075 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGF8P55075 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGF8P55075 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGF8P55075 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGF8P55075 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGF8P55075 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGF8P55075 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGF8P55075 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGF8P55075 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FGF8P55075 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGF8P55075 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGF8P55075 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGF8P55075 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGF8P55075 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGF8P55075 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGF8P55075 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGF8P55075 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FGF8P55075 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FGF8P55075 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FGF8P55075 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FGF8P55075 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FGF8P55075 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FGF8P55075 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FGF8P55075 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FGF8P55075 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FGF8P55075 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGF8P55075 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGF8P55075 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGF8P55075 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FGF8P55075 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGF8P55075 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGF8P55075 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FGF8P55075 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FGF8P55075 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FGF8P55075 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FGF8P55075 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGF8P55075 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGF8P55075 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGF8P55075 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGF8P55075 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGF8P55075 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGF8P55075 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGF8P55075 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGF8P55075 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FGF8P55075 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGF8P55075 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGF8P55075 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGF8P55075 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGF8P55075 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGF8P55075 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGF8P55075 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGF8P55075 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGF8P55075 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FGF8P55075 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FGF8P55075 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGF8P55075 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGF8P55075 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms