Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD4P55036 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD4P55036 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD4P55036 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD4P55036 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD4P55036 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD4P55036 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD4P55036 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD4P55036 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD4P55036 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD4P55036 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD4P55036 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD4P55036 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD4P55036 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD4P55036 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD4P55036 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD4P55036 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD4P55036 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD4P55036 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD4P55036 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMD4P55036 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD4P55036 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD4P55036 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD4P55036 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD4P55036 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD4P55036 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD4P55036 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD4P55036 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD4P55036 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD4P55036 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD4P55036 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD4P55036 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD4P55036 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD4P55036 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD4P55036 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSMD4P55036 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD4P55036 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD4P55036 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD4P55036 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD4P55036 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD4P55036 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD4P55036 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD4P55036 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD4P55036 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD4P55036 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD4P55036 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD4P55036 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD4P55036 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD4P55036 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD4P55036 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD4P55036 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD4P55036 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD4P55036 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD4P55036 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD4P55036 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD4P55036 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD4P55036 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD4P55036 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD4P55036 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD4P55036 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD4P55036 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD4P55036 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD4P55036 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD4P55036 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD4P55036 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD4P55036 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD4P55036 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD4P55036 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMD4P55036 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMD4P55036 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD4P55036 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD4P55036 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD4P55036 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD4P55036 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD4P55036 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD4P55036 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD4P55036 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD4P55036 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD4P55036 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD4P55036 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD4P55036 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD4P55036 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD4P55036 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD4P55036 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD4P55036 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD4P55036 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD4P55036 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD4P55036 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD4P55036 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD4P55036 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD4P55036 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD4P55036 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD4P55036 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD4P55036 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD4P55036 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD4P55036 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD4P55036 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD4P55036 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD4P55036 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD4P55036 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 861.3 ms