Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
AIF1P55008 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AIF1P55008 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AIF1P55008 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AIF1P55008 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
AIF1P55008 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AIF1P55008 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AIF1P55008 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AIF1P55008 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AIF1P55008 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AIF1P55008 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AIF1P55008 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AIF1P55008 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AIF1P55008 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AIF1P55008 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AIF1P55008 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AIF1P55008 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AIF1P55008 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AIF1P55008 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AIF1P55008 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AIF1P55008 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AIF1P55008 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AIF1P55008 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
AIF1P55008 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
AIF1P55008 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AIF1P55008 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AIF1P55008 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AIF1P55008 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AIF1P55008 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.54■■■□□ 2
AIF1P55008 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
AIF1P55008 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AIF1P55008 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AIF1P55008 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.52■■■□□ 2
AIF1P55008 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AIF1P55008 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.52■■■□□ 2
AIF1P55008 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AIF1P55008 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AIF1P55008 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AIF1P55008 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AIF1P55008 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AIF1P55008 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AIF1P55008 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AIF1P55008 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AIF1P55008 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
AIF1P55008 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AIF1P55008 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AIF1P55008 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AIF1P55008 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
AIF1P55008 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AIF1P55008 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AIF1P55008 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AIF1P55008 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AIF1P55008 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AIF1P55008 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AIF1P55008 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AIF1P55008 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AIF1P55008 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AIF1P55008 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AIF1P55008 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AIF1P55008 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AIF1P55008 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AIF1P55008 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AIF1P55008 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
AIF1P55008 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AIF1P55008 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AIF1P55008 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AIF1P55008 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
AIF1P55008 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AIF1P55008 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AIF1P55008 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AIF1P55008 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AIF1P55008 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
AIF1P55008 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AIF1P55008 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AIF1P55008 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
AIF1P55008 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AIF1P55008 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AIF1P55008 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AIF1P55008 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
AIF1P55008 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AIF1P55008 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AIF1P55008 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AIF1P55008 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AIF1P55008 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AIF1P55008 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AIF1P55008 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AIF1P55008 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AIF1P55008 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AIF1P55008 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AIF1P55008 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AIF1P55008 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AIF1P55008 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
AIF1P55008 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AIF1P55008 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AIF1P55008 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AIF1P55008 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AIF1P55008 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AIF1P55008 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AIF1P55008 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AIF1P55008 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms