Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2D1P51668 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2D1P51668 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2D1P51668 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2D1P51668 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2D1P51668 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2D1P51668 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2D1P51668 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2D1P51668 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2D1P51668 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2D1P51668 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2D1P51668 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2D1P51668 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2D1P51668 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2D1P51668 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2D1P51668 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2D1P51668 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2D1P51668 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2D1P51668 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2D1P51668 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2D1P51668 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2D1P51668 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2D1P51668 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2D1P51668 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2D1P51668 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2D1P51668 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2D1P51668 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2D1P51668 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2D1P51668 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2D1P51668 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2D1P51668 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2D1P51668 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2D1P51668 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2D1P51668 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2D1P51668 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBE2D1P51668 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE2D1P51668 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2D1P51668 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2D1P51668 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2D1P51668 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2D1P51668 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2D1P51668 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2D1P51668 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2D1P51668 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2D1P51668 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2D1P51668 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2D1P51668 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2D1P51668 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2D1P51668 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2D1P51668 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2D1P51668 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2D1P51668 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2D1P51668 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2D1P51668 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2D1P51668 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2D1P51668 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2D1P51668 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2D1P51668 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2D1P51668 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2D1P51668 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2D1P51668 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE2D1P51668 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE2D1P51668 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2D1P51668 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2D1P51668 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2D1P51668 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2D1P51668 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2D1P51668 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2D1P51668 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2D1P51668 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms