Protein–RNA interactions for Protein: P51608

MECP2, Methyl-CpG-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MECP2P51608 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MECP2P51608 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MECP2P51608 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MECP2P51608 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MECP2P51608 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MECP2P51608 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MECP2P51608 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MECP2P51608 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MECP2P51608 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MECP2P51608 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MECP2P51608 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MECP2P51608 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MECP2P51608 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MECP2P51608 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MECP2P51608 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MECP2P51608 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MECP2P51608 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MECP2P51608 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MECP2P51608 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MECP2P51608 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MECP2P51608 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MECP2P51608 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MECP2P51608 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MECP2P51608 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MECP2P51608 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MECP2P51608 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MECP2P51608 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MECP2P51608 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MECP2P51608 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MECP2P51608 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MECP2P51608 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MECP2P51608 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MECP2P51608 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MECP2P51608 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MECP2P51608 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MECP2P51608 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MECP2P51608 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MECP2P51608 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MECP2P51608 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MECP2P51608 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MECP2P51608 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MECP2P51608 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MECP2P51608 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MECP2P51608 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MECP2P51608 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MECP2P51608 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MECP2P51608 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MECP2P51608 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MECP2P51608 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MECP2P51608 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MECP2P51608 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MECP2P51608 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MECP2P51608 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MECP2P51608 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MECP2P51608 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MECP2P51608 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MECP2P51608 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MECP2P51608 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MECP2P51608 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MECP2P51608 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MECP2P51608 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MECP2P51608 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MECP2P51608 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MECP2P51608 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MECP2P51608 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MECP2P51608 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MECP2P51608 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MECP2P51608 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MECP2P51608 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MECP2P51608 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MECP2P51608 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MECP2P51608 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MECP2P51608 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MECP2P51608 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MECP2P51608 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MECP2P51608 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MECP2P51608 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MECP2P51608 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MECP2P51608 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MECP2P51608 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MECP2P51608 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MECP2P51608 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MECP2P51608 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MECP2P51608 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MECP2P51608 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MECP2P51608 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MECP2P51608 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MECP2P51608 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MECP2P51608 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MECP2P51608 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MECP2P51608 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MECP2P51608 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MECP2P51608 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MECP2P51608 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MECP2P51608 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MECP2P51608 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MECP2P51608 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MECP2P51608 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MECP2P51608 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MECP2P51608 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms