Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RORCP51449 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RORCP51449 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RORCP51449 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RORCP51449 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RORCP51449 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RORCP51449 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RORCP51449 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RORCP51449 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RORCP51449 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RORCP51449 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RORCP51449 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RORCP51449 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RORCP51449 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RORCP51449 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RORCP51449 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RORCP51449 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RORCP51449 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RORCP51449 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RORCP51449 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RORCP51449 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RORCP51449 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RORCP51449 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RORCP51449 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RORCP51449 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RORCP51449 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RORCP51449 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RORCP51449 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RORCP51449 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RORCP51449 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RORCP51449 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RORCP51449 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RORCP51449 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RORCP51449 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RORCP51449 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RORCP51449 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RORCP51449 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RORCP51449 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RORCP51449 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RORCP51449 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RORCP51449 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RORCP51449 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RORCP51449 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RORCP51449 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RORCP51449 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RORCP51449 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RORCP51449 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RORCP51449 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RORCP51449 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RORCP51449 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RORCP51449 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RORCP51449 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RORCP51449 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RORCP51449 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RORCP51449 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RORCP51449 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RORCP51449 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RORCP51449 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RORCP51449 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RORCP51449 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RORCP51449 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RORCP51449 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RORCP51449 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RORCP51449 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RORCP51449 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RORCP51449 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RORCP51449 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RORCP51449 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RORCP51449 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RORCP51449 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RORCP51449 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RORCP51449 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RORCP51449 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RORCP51449 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RORCP51449 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RORCP51449 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RORCP51449 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RORCP51449 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RORCP51449 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RORCP51449 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RORCP51449 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RORCP51449 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RORCP51449 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RORCP51449 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RORCP51449 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RORCP51449 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RORCP51449 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RORCP51449 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RORCP51449 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RORCP51449 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RORCP51449 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RORCP51449 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RORCP51449 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RORCP51449 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RORCP51449 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RORCP51449 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RORCP51449 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RORCP51449 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RORCP51449 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RORCP51449 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms