Protein–RNA interactions for Protein: P50553

ASCL1, Achaete-scute homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL1P50553 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASCL1P50553 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASCL1P50553 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASCL1P50553 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASCL1P50553 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASCL1P50553 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASCL1P50553 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASCL1P50553 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASCL1P50553 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASCL1P50553 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASCL1P50553 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASCL1P50553 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASCL1P50553 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASCL1P50553 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASCL1P50553 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASCL1P50553 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASCL1P50553 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ASCL1P50553 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASCL1P50553 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASCL1P50553 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASCL1P50553 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASCL1P50553 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASCL1P50553 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms