Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PITPNBP48739 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PITPNBP48739 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITPNBP48739 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITPNBP48739 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITPNBP48739 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNBP48739 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNBP48739 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITPNBP48739 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNBP48739 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNBP48739 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNBP48739 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNBP48739 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNBP48739 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNBP48739 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNBP48739 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PITPNBP48739 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PITPNBP48739 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PITPNBP48739 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITPNBP48739 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNBP48739 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNBP48739 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNBP48739 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNBP48739 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNBP48739 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNBP48739 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNBP48739 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNBP48739 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNBP48739 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNBP48739 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNBP48739 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITPNBP48739 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PITPNBP48739 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITPNBP48739 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITPNBP48739 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITPNBP48739 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITPNBP48739 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITPNBP48739 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITPNBP48739 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITPNBP48739 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITPNBP48739 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITPNBP48739 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITPNBP48739 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITPNBP48739 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITPNBP48739 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PITPNBP48739 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITPNBP48739 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITPNBP48739 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITPNBP48739 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITPNBP48739 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITPNBP48739 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITPNBP48739 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITPNBP48739 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITPNBP48739 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITPNBP48739 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITPNBP48739 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITPNBP48739 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITPNBP48739 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITPNBP48739 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITPNBP48739 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITPNBP48739 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITPNBP48739 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITPNBP48739 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITPNBP48739 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITPNBP48739 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITPNBP48739 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITPNBP48739 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITPNBP48739 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITPNBP48739 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITPNBP48739 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITPNBP48739 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITPNBP48739 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITPNBP48739 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITPNBP48739 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITPNBP48739 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITPNBP48739 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PITPNBP48739 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITPNBP48739 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITPNBP48739 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITPNBP48739 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITPNBP48739 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITPNBP48739 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PITPNBP48739 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITPNBP48739 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITPNBP48739 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITPNBP48739 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITPNBP48739 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITPNBP48739 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITPNBP48739 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITPNBP48739 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITPNBP48739 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITPNBP48739 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITPNBP48739 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITPNBP48739 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITPNBP48739 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITPNBP48739 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITPNBP48739 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITPNBP48739 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITPNBP48739 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PITPNBP48739 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms