Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD52P43351 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD52P43351 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAD52P43351 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD52P43351 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD52P43351 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD52P43351 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD52P43351 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD52P43351 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD52P43351 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD52P43351 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD52P43351 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD52P43351 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD52P43351 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD52P43351 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD52P43351 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD52P43351 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD52P43351 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD52P43351 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD52P43351 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD52P43351 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD52P43351 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD52P43351 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD52P43351 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD52P43351 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD52P43351 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD52P43351 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD52P43351 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD52P43351 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD52P43351 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD52P43351 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD52P43351 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD52P43351 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD52P43351 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD52P43351 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD52P43351 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD52P43351 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD52P43351 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD52P43351 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD52P43351 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD52P43351 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD52P43351 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD52P43351 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD52P43351 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD52P43351 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD52P43351 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD52P43351 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD52P43351 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD52P43351 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD52P43351 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD52P43351 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD52P43351 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD52P43351 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD52P43351 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD52P43351 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD52P43351 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD52P43351 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD52P43351 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD52P43351 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD52P43351 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD52P43351 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD52P43351 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD52P43351 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD52P43351 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD52P43351 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD52P43351 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD52P43351 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD52P43351 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD52P43351 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD52P43351 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD52P43351 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD52P43351 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD52P43351 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD52P43351 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD52P43351 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD52P43351 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD52P43351 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD52P43351 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD52P43351 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD52P43351 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD52P43351 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD52P43351 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD52P43351 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD52P43351 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD52P43351 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD52P43351 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD52P43351 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD52P43351 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD52P43351 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD52P43351 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD52P43351 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD52P43351 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD52P43351 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD52P43351 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD52P43351 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD52P43351 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD52P43351 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD52P43351 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD52P43351 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD52P43351 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms