Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT9P35527 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT9P35527 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT9P35527 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT9P35527 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT9P35527 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT9P35527 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT9P35527 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT9P35527 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT9P35527 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT9P35527 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT9P35527 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT9P35527 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT9P35527 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT9P35527 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT9P35527 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT9P35527 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT9P35527 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KRT9P35527 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KRT9P35527 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KRT9P35527 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT9P35527 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT9P35527 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT9P35527 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT9P35527 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT9P35527 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT9P35527 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT9P35527 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT9P35527 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT9P35527 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRT9P35527 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRT9P35527 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT9P35527 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT9P35527 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT9P35527 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT9P35527 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT9P35527 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT9P35527 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT9P35527 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT9P35527 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT9P35527 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT9P35527 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT9P35527 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT9P35527 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT9P35527 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT9P35527 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT9P35527 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT9P35527 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT9P35527 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT9P35527 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT9P35527 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT9P35527 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT9P35527 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT9P35527 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT9P35527 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT9P35527 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT9P35527 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT9P35527 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT9P35527 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT9P35527 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT9P35527 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT9P35527 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT9P35527 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT9P35527 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT9P35527 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT9P35527 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT9P35527 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT9P35527 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT9P35527 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT9P35527 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT9P35527 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT9P35527 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT9P35527 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT9P35527 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT9P35527 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT9P35527 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT9P35527 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT9P35527 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT9P35527 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT9P35527 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT9P35527 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT9P35527 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT9P35527 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT9P35527 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT9P35527 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT9P35527 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT9P35527 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT9P35527 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT9P35527 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT9P35527 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT9P35527 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT9P35527 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT9P35527 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT9P35527 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT9P35527 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT9P35527 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT9P35527 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT9P35527 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT9P35527 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT9P35527 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms