Protein–RNA interactions for Protein: P35442

THBS2, Thrombospondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS2P35442 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THBS2P35442 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THBS2P35442 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THBS2P35442 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THBS2P35442 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THBS2P35442 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THBS2P35442 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THBS2P35442 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THBS2P35442 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THBS2P35442 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
THBS2P35442 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THBS2P35442 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THBS2P35442 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THBS2P35442 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THBS2P35442 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THBS2P35442 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THBS2P35442 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THBS2P35442 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THBS2P35442 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THBS2P35442 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THBS2P35442 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THBS2P35442 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THBS2P35442 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
THBS2P35442 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THBS2P35442 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
THBS2P35442 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THBS2P35442 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THBS2P35442 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THBS2P35442 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THBS2P35442 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THBS2P35442 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THBS2P35442 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THBS2P35442 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THBS2P35442 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THBS2P35442 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
THBS2P35442 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THBS2P35442 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THBS2P35442 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THBS2P35442 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THBS2P35442 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THBS2P35442 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
THBS2P35442 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THBS2P35442 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THBS2P35442 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
THBS2P35442 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
THBS2P35442 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THBS2P35442 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THBS2P35442 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THBS2P35442 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THBS2P35442 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THBS2P35442 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THBS2P35442 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THBS2P35442 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THBS2P35442 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THBS2P35442 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THBS2P35442 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THBS2P35442 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THBS2P35442 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THBS2P35442 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THBS2P35442 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THBS2P35442 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THBS2P35442 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THBS2P35442 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THBS2P35442 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THBS2P35442 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THBS2P35442 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THBS2P35442 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THBS2P35442 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THBS2P35442 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THBS2P35442 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THBS2P35442 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THBS2P35442 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THBS2P35442 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THBS2P35442 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
THBS2P35442 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THBS2P35442 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THBS2P35442 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THBS2P35442 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THBS2P35442 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THBS2P35442 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THBS2P35442 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THBS2P35442 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THBS2P35442 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THBS2P35442 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THBS2P35442 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THBS2P35442 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THBS2P35442 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THBS2P35442 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THBS2P35442 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THBS2P35442 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THBS2P35442 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THBS2P35442 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
THBS2P35442 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THBS2P35442 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
THBS2P35442 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
THBS2P35442 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THBS2P35442 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THBS2P35442 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THBS2P35442 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THBS2P35442 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms