Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MCM5P33992 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MCM5P33992 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
MCM5P33992 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MCM5P33992 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MCM5P33992 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MCM5P33992 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MCM5P33992 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MCM5P33992 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MCM5P33992 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MCM5P33992 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
MCM5P33992 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MCM5P33992 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MCM5P33992 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MCM5P33992 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MCM5P33992 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MCM5P33992 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MCM5P33992 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
MCM5P33992 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MCM5P33992 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
MCM5P33992 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
MCM5P33992 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
MCM5P33992 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MCM5P33992 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MCM5P33992 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MCM5P33992 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MCM5P33992 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MCM5P33992 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
MCM5P33992 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MCM5P33992 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
MCM5P33992 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MCM5P33992 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MCM5P33992 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
MCM5P33992 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MCM5P33992 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MCM5P33992 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MCM5P33992 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
MCM5P33992 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
MCM5P33992 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MCM5P33992 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MCM5P33992 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
MCM5P33992 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
MCM5P33992 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
MCM5P33992 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
MCM5P33992 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
MCM5P33992 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MCM5P33992 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MCM5P33992 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
MCM5P33992 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MCM5P33992 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MCM5P33992 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
MCM5P33992 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
MCM5P33992 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
MCM5P33992 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
MCM5P33992 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
MCM5P33992 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
MCM5P33992 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
MCM5P33992 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
MCM5P33992 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
MCM5P33992 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
MCM5P33992 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
MCM5P33992 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
MCM5P33992 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
MCM5P33992 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
MCM5P33992 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
MCM5P33992 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
MCM5P33992 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
MCM5P33992 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
MCM5P33992 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
MCM5P33992 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MCM5P33992 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
MCM5P33992 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
MCM5P33992 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
MCM5P33992 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
MCM5P33992 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
MCM5P33992 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
MCM5P33992 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
MCM5P33992 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
MCM5P33992 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
MCM5P33992 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MCM5P33992 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
MCM5P33992 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
MCM5P33992 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MCM5P33992 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
MCM5P33992 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MCM5P33992 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MCM5P33992 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MCM5P33992 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MCM5P33992 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MCM5P33992 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
MCM5P33992 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MCM5P33992 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
MCM5P33992 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MCM5P33992 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MCM5P33992 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
MCM5P33992 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MCM5P33992 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MCM5P33992 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MCM5P33992 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
MCM5P33992 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms