Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRA5P31644 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRA5P31644 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRA5P31644 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRA5P31644 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRA5P31644 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRA5P31644 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRA5P31644 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRA5P31644 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRA5P31644 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRA5P31644 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABRA5P31644 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABRA5P31644 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRA5P31644 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRA5P31644 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRA5P31644 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRA5P31644 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRA5P31644 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRA5P31644 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRA5P31644 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRA5P31644 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRA5P31644 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRA5P31644 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRA5P31644 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRA5P31644 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRA5P31644 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRA5P31644 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRA5P31644 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRA5P31644 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRA5P31644 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRA5P31644 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRA5P31644 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRA5P31644 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRA5P31644 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRA5P31644 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRA5P31644 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRA5P31644 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRA5P31644 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRA5P31644 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRA5P31644 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRA5P31644 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRA5P31644 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRA5P31644 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRA5P31644 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRA5P31644 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRA5P31644 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRA5P31644 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRA5P31644 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRA5P31644 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRA5P31644 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRA5P31644 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRA5P31644 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRA5P31644 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRA5P31644 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRA5P31644 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRA5P31644 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRA5P31644 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRA5P31644 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRA5P31644 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRA5P31644 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRA5P31644 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRA5P31644 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRA5P31644 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRA5P31644 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRA5P31644 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRA5P31644 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRA5P31644 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRA5P31644 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABRA5P31644 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRA5P31644 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRA5P31644 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRA5P31644 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRA5P31644 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRA5P31644 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRA5P31644 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms