Protein–RNA interactions for Protein: P30825

SLC7A1, High affinity cationic amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A1P30825 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC7A1P30825 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC7A1P30825 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC7A1P30825 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC7A1P30825 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC7A1P30825 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC7A1P30825 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC7A1P30825 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC7A1P30825 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC7A1P30825 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC7A1P30825 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC7A1P30825 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC7A1P30825 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC7A1P30825 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC7A1P30825 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC7A1P30825 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC7A1P30825 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC7A1P30825 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC7A1P30825 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC7A1P30825 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC7A1P30825 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC7A1P30825 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC7A1P30825 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC7A1P30825 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC7A1P30825 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC7A1P30825 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC7A1P30825 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC7A1P30825 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC7A1P30825 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC7A1P30825 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC7A1P30825 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC7A1P30825 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC7A1P30825 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC7A1P30825 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC7A1P30825 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC7A1P30825 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC7A1P30825 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC7A1P30825 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC7A1P30825 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC7A1P30825 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC7A1P30825 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC7A1P30825 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC7A1P30825 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC7A1P30825 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC7A1P30825 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC7A1P30825 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC7A1P30825 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC7A1P30825 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC7A1P30825 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC7A1P30825 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC7A1P30825 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC7A1P30825 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC7A1P30825 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC7A1P30825 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC7A1P30825 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC7A1P30825 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC7A1P30825 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC7A1P30825 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC7A1P30825 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC7A1P30825 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC7A1P30825 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC7A1P30825 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC7A1P30825 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC7A1P30825 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC7A1P30825 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC7A1P30825 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC7A1P30825 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC7A1P30825 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC7A1P30825 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC7A1P30825 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC7A1P30825 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC7A1P30825 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC7A1P30825 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC7A1P30825 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC7A1P30825 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC7A1P30825 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC7A1P30825 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC7A1P30825 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC7A1P30825 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC7A1P30825 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC7A1P30825 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC7A1P30825 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC7A1P30825 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC7A1P30825 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC7A1P30825 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC7A1P30825 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC7A1P30825 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC7A1P30825 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC7A1P30825 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC7A1P30825 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC7A1P30825 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC7A1P30825 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC7A1P30825 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC7A1P30825 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC7A1P30825 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC7A1P30825 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC7A1P30825 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC7A1P30825 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC7A1P30825 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC7A1P30825 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms