Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMA1P25786 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMA1P25786 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMA1P25786 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMA1P25786 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMA1P25786 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMA1P25786 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PSMA1P25786 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PSMA1P25786 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMA1P25786 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMA1P25786 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMA1P25786 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMA1P25786 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMA1P25786 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMA1P25786 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMA1P25786 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMA1P25786 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMA1P25786 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMA1P25786 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMA1P25786 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMA1P25786 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMA1P25786 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMA1P25786 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMA1P25786 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMA1P25786 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMA1P25786 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMA1P25786 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMA1P25786 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMA1P25786 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMA1P25786 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMA1P25786 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMA1P25786 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMA1P25786 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMA1P25786 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSMA1P25786 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMA1P25786 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMA1P25786 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMA1P25786 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMA1P25786 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMA1P25786 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMA1P25786 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMA1P25786 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMA1P25786 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMA1P25786 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMA1P25786 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMA1P25786 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMA1P25786 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMA1P25786 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMA1P25786 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMA1P25786 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMA1P25786 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMA1P25786 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMA1P25786 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMA1P25786 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMA1P25786 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMA1P25786 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMA1P25786 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMA1P25786 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMA1P25786 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMA1P25786 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMA1P25786 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMA1P25786 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMA1P25786 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMA1P25786 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMA1P25786 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMA1P25786 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMA1P25786 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSMA1P25786 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMA1P25786 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMA1P25786 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMA1P25786 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMA1P25786 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMA1P25786 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMA1P25786 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMA1P25786 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA1P25786 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA1P25786 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA1P25786 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA1P25786 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA1P25786 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMA1P25786 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMA1P25786 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMA1P25786 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMA1P25786 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMA1P25786 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMA1P25786 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMA1P25786 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMA1P25786 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA1P25786 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA1P25786 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA1P25786 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA1P25786 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA1P25786 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMA1P25786 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMA1P25786 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMA1P25786 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMA1P25786 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSMA1P25786 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PSMA1P25786 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSMA1P25786 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms