Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT4P19013 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT4P19013 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT4P19013 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT4P19013 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT4P19013 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT4P19013 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT4P19013 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT4P19013 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT4P19013 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT4P19013 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT4P19013 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT4P19013 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT4P19013 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT4P19013 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT4P19013 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT4P19013 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT4P19013 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT4P19013 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT4P19013 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT4P19013 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT4P19013 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT4P19013 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT4P19013 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT4P19013 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT4P19013 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT4P19013 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT4P19013 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT4P19013 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT4P19013 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT4P19013 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT4P19013 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT4P19013 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT4P19013 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT4P19013 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT4P19013 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT4P19013 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT4P19013 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT4P19013 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT4P19013 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT4P19013 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT4P19013 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT4P19013 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT4P19013 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT4P19013 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT4P19013 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT4P19013 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT4P19013 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT4P19013 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT4P19013 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT4P19013 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT4P19013 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT4P19013 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT4P19013 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT4P19013 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT4P19013 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT4P19013 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT4P19013 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT4P19013 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT4P19013 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT4P19013 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
KRT4P19013 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT4P19013 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT4P19013 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT4P19013 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT4P19013 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT4P19013 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT4P19013 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT4P19013 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT4P19013 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT4P19013 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT4P19013 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT4P19013 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRT4P19013 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT4P19013 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT4P19013 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT4P19013 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT4P19013 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT4P19013 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT4P19013 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT4P19013 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT4P19013 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT4P19013 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT4P19013 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT4P19013 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT4P19013 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT4P19013 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT4P19013 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT4P19013 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT4P19013 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT4P19013 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT4P19013 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT4P19013 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT4P19013 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT4P19013 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT4P19013 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT4P19013 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT4P19013 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT4P19013 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT4P19013 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms