Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGB6P18564 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB6P18564 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB6P18564 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB6P18564 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB6P18564 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB6P18564 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB6P18564 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB6P18564 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB6P18564 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB6P18564 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB6P18564 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB6P18564 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB6P18564 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB6P18564 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB6P18564 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB6P18564 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB6P18564 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB6P18564 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB6P18564 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB6P18564 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB6P18564 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB6P18564 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB6P18564 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB6P18564 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB6P18564 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB6P18564 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB6P18564 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB6P18564 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB6P18564 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB6P18564 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB6P18564 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ITGB6P18564 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB6P18564 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB6P18564 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB6P18564 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB6P18564 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB6P18564 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB6P18564 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB6P18564 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB6P18564 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB6P18564 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB6P18564 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB6P18564 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB6P18564 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB6P18564 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB6P18564 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB6P18564 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB6P18564 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB6P18564 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB6P18564 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB6P18564 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB6P18564 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB6P18564 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB6P18564 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB6P18564 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB6P18564 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB6P18564 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB6P18564 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB6P18564 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB6P18564 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ITGB6P18564 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB6P18564 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB6P18564 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB6P18564 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB6P18564 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB6P18564 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB6P18564 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB6P18564 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB6P18564 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB6P18564 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB6P18564 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB6P18564 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB6P18564 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB6P18564 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB6P18564 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB6P18564 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB6P18564 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB6P18564 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB6P18564 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB6P18564 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB6P18564 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB6P18564 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB6P18564 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB6P18564 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB6P18564 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB6P18564 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB6P18564 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB6P18564 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB6P18564 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB6P18564 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB6P18564 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB6P18564 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB6P18564 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB6P18564 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB6P18564 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB6P18564 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB6P18564 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB6P18564 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms