Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA2P17301 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA2P17301 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA2P17301 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA2P17301 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA2P17301 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA2P17301 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA2P17301 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA2P17301 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA2P17301 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA2P17301 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA2P17301 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA2P17301 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA2P17301 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA2P17301 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA2P17301 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA2P17301 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA2P17301 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA2P17301 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA2P17301 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGA2P17301 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGA2P17301 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA2P17301 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA2P17301 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA2P17301 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA2P17301 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA2P17301 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA2P17301 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA2P17301 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA2P17301 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA2P17301 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGA2P17301 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA2P17301 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA2P17301 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA2P17301 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA2P17301 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA2P17301 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA2P17301 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA2P17301 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA2P17301 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA2P17301 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA2P17301 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGA2P17301 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA2P17301 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA2P17301 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA2P17301 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA2P17301 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA2P17301 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA2P17301 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA2P17301 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA2P17301 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA2P17301 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA2P17301 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA2P17301 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA2P17301 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA2P17301 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA2P17301 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA2P17301 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA2P17301 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA2P17301 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA2P17301 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA2P17301 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA2P17301 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA2P17301 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA2P17301 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA2P17301 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA2P17301 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA2P17301 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA2P17301 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA2P17301 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA2P17301 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA2P17301 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA2P17301 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA2P17301 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA2P17301 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms