Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCAP17252 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCAP17252 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCAP17252 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCAP17252 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCAP17252 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCAP17252 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCAP17252 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCAP17252 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCAP17252 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCAP17252 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCAP17252 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCAP17252 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCAP17252 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCAP17252 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCAP17252 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCAP17252 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCAP17252 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCAP17252 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCAP17252 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCAP17252 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCAP17252 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCAP17252 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCAP17252 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCAP17252 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCAP17252 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCAP17252 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCAP17252 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCAP17252 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCAP17252 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCAP17252 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCAP17252 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCAP17252 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCAP17252 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCAP17252 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCAP17252 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCAP17252 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCAP17252 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCAP17252 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCAP17252 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCAP17252 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCAP17252 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCAP17252 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCAP17252 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCAP17252 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCAP17252 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCAP17252 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCAP17252 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCAP17252 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCAP17252 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCAP17252 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRKCAP17252 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRKCAP17252 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCAP17252 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCAP17252 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCAP17252 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCAP17252 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCAP17252 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCAP17252 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCAP17252 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCAP17252 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCAP17252 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCAP17252 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCAP17252 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCAP17252 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCAP17252 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCAP17252 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCAP17252 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCAP17252 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCAP17252 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCAP17252 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCAP17252 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKCAP17252 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCAP17252 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCAP17252 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCAP17252 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCAP17252 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCAP17252 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCAP17252 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCAP17252 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCAP17252 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCAP17252 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCAP17252 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCAP17252 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCAP17252 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCAP17252 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCAP17252 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCAP17252 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCAP17252 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCAP17252 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCAP17252 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCAP17252 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCAP17252 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCAP17252 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCAP17252 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCAP17252 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCAP17252 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCAP17252 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCAP17252 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCAP17252 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms