Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCF3P15923 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TCF3P15923 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TCF3P15923 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TCF3P15923 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TCF3P15923 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TCF3P15923 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TCF3P15923 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCF3P15923 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCF3P15923 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TCF3P15923 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCF3P15923 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCF3P15923 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCF3P15923 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCF3P15923 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCF3P15923 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCF3P15923 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TCF3P15923 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCF3P15923 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TCF3P15923 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCF3P15923 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCF3P15923 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCF3P15923 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCF3P15923 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCF3P15923 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCF3P15923 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCF3P15923 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCF3P15923 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCF3P15923 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCF3P15923 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TCF3P15923 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCF3P15923 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCF3P15923 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCF3P15923 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCF3P15923 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCF3P15923 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TCF3P15923 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCF3P15923 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCF3P15923 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCF3P15923 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCF3P15923 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCF3P15923 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCF3P15923 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCF3P15923 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCF3P15923 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCF3P15923 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCF3P15923 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCF3P15923 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCF3P15923 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCF3P15923 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCF3P15923 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCF3P15923 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCF3P15923 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCF3P15923 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TCF3P15923 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TCF3P15923 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TCF3P15923 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TCF3P15923 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TCF3P15923 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TCF3P15923 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TCF3P15923 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TCF3P15923 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TCF3P15923 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TCF3P15923 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TCF3P15923 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TCF3P15923 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TCF3P15923 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCF3P15923 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCF3P15923 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCF3P15923 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCF3P15923 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCF3P15923 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCF3P15923 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCF3P15923 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCF3P15923 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCF3P15923 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCF3P15923 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCF3P15923 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCF3P15923 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCF3P15923 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TCF3P15923 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCF3P15923 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCF3P15923 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCF3P15923 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCF3P15923 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCF3P15923 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCF3P15923 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCF3P15923 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCF3P15923 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCF3P15923 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TCF3P15923 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCF3P15923 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCF3P15923 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCF3P15923 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCF3P15923 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCF3P15923 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCF3P15923 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCF3P15923 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCF3P15923 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCF3P15923 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 291.8 ms