Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT13P13646 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT13P13646 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT13P13646 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT13P13646 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT13P13646 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT13P13646 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT13P13646 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT13P13646 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT13P13646 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT13P13646 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT13P13646 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT13P13646 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KRT13P13646 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KRT13P13646 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT13P13646 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT13P13646 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT13P13646 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT13P13646 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT13P13646 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT13P13646 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT13P13646 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT13P13646 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT13P13646 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
KRT13P13646 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT13P13646 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT13P13646 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT13P13646 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT13P13646 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT13P13646 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT13P13646 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT13P13646 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT13P13646 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT13P13646 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT13P13646 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT13P13646 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT13P13646 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KRT13P13646 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT13P13646 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT13P13646 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT13P13646 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT13P13646 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT13P13646 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT13P13646 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT13P13646 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT13P13646 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT13P13646 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT13P13646 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT13P13646 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT13P13646 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT13P13646 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT13P13646 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT13P13646 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT13P13646 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT13P13646 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT13P13646 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT13P13646 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT13P13646 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT13P13646 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT13P13646 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT13P13646 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT13P13646 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT13P13646 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT13P13646 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT13P13646 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT13P13646 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT13P13646 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT13P13646 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
KRT13P13646 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT13P13646 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT13P13646 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT13P13646 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT13P13646 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT13P13646 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT13P13646 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT13P13646 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT13P13646 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT13P13646 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT13P13646 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT13P13646 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT13P13646 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT13P13646 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT13P13646 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT13P13646 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT13P13646 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT13P13646 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT13P13646 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT13P13646 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KRT13P13646 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
KRT13P13646 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT13P13646 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT13P13646 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT13P13646 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT13P13646 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT13P13646 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT13P13646 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT13P13646 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT13P13646 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT13P13646 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT13P13646 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms