Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30■■■□□ 2.39
ACTN1P12814 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ACTN1P12814 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ACTN1P12814 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ACTN1P12814 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ACTN1P12814 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ACTN1P12814 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ACTN1P12814 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ACTN1P12814 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ACTN1P12814 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ACTN1P12814 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ACTN1P12814 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ACTN1P12814 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ACTN1P12814 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ACTN1P12814 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ACTN1P12814 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ACTN1P12814 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ACTN1P12814 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ACTN1P12814 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ACTN1P12814 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ACTN1P12814 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ACTN1P12814 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ACTN1P12814 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ACTN1P12814 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ACTN1P12814 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ACTN1P12814 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ACTN1P12814 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ACTN1P12814 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ACTN1P12814 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ACTN1P12814 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ACTN1P12814 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ACTN1P12814 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ACTN1P12814 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ACTN1P12814 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ACTN1P12814 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ACTN1P12814 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ACTN1P12814 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ACTN1P12814 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ACTN1P12814 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ACTN1P12814 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ACTN1P12814 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ACTN1P12814 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ACTN1P12814 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ACTN1P12814 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ACTN1P12814 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ACTN1P12814 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ACTN1P12814 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ACTN1P12814 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ACTN1P12814 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ACTN1P12814 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ACTN1P12814 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ACTN1P12814 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ACTN1P12814 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ACTN1P12814 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ACTN1P12814 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ACTN1P12814 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ACTN1P12814 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ACTN1P12814 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ACTN1P12814 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ACTN1P12814 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ACTN1P12814 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ACTN1P12814 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ACTN1P12814 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ACTN1P12814 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ACTN1P12814 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ACTN1P12814 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ACTN1P12814 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ACTN1P12814 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ACTN1P12814 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ACTN1P12814 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ACTN1P12814 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ACTN1P12814 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ACTN1P12814 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ACTN1P12814 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ACTN1P12814 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ACTN1P12814 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ACTN1P12814 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ACTN1P12814 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ACTN1P12814 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ACTN1P12814 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ACTN1P12814 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ACTN1P12814 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ACTN1P12814 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ACTN1P12814 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ACTN1P12814 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ACTN1P12814 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ACTN1P12814 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ACTN1P12814 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ACTN1P12814 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ACTN1P12814 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ACTN1P12814 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ACTN1P12814 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ACTN1P12814 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ACTN1P12814 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ACTN1P12814 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ACTN1P12814 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ACTN1P12814 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ACTN1P12814 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ACTN1P12814 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ACTN1P12814 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms