Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CYP2C9P11712 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CYP2C9P11712 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CYP2C9P11712 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CYP2C9P11712 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CYP2C9P11712 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CYP2C9P11712 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CYP2C9P11712 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CYP2C9P11712 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CYP2C9P11712 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CYP2C9P11712 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CYP2C9P11712 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CYP2C9P11712 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CYP2C9P11712 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CYP2C9P11712 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CYP2C9P11712 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CYP2C9P11712 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CYP2C9P11712 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CYP2C9P11712 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CYP2C9P11712 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CYP2C9P11712 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CYP2C9P11712 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CYP2C9P11712 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
CYP2C9P11712 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CYP2C9P11712 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CYP2C9P11712 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CYP2C9P11712 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CYP2C9P11712 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CYP2C9P11712 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CYP2C9P11712 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CYP2C9P11712 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CYP2C9P11712 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CYP2C9P11712 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CYP2C9P11712 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CYP2C9P11712 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CYP2C9P11712 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CYP2C9P11712 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CYP2C9P11712 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CYP2C9P11712 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CYP2C9P11712 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CYP2C9P11712 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CYP2C9P11712 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CYP2C9P11712 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CYP2C9P11712 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CYP2C9P11712 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CYP2C9P11712 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CYP2C9P11712 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CYP2C9P11712 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CYP2C9P11712 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CYP2C9P11712 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CYP2C9P11712 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CYP2C9P11712 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CYP2C9P11712 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CYP2C9P11712 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CYP2C9P11712 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CYP2C9P11712 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CYP2C9P11712 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CYP2C9P11712 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CYP2C9P11712 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CYP2C9P11712 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CYP2C9P11712 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CYP2C9P11712 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CYP2C9P11712 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CYP2C9P11712 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CYP2C9P11712 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CYP2C9P11712 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CYP2C9P11712 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CYP2C9P11712 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CYP2C9P11712 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CYP2C9P11712 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CYP2C9P11712 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CYP2C9P11712 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CYP2C9P11712 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CYP2C9P11712 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CYP2C9P11712 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CYP2C9P11712 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CYP2C9P11712 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CYP2C9P11712 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CYP2C9P11712 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CYP2C9P11712 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CYP2C9P11712 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CYP2C9P11712 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CYP2C9P11712 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CYP2C9P11712 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CYP2C9P11712 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CYP2C9P11712 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CYP2C9P11712 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CYP2C9P11712 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CYP2C9P11712 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CYP2C9P11712 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CYP2C9P11712 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CYP2C9P11712 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CYP2C9P11712 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CYP2C9P11712 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CYP2C9P11712 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CYP2C9P11712 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CYP2C9P11712 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CYP2C9P11712 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CYP2C9P11712 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CYP2C9P11712 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms