Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB1

PRR23D2, Proline-rich protein 23D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23D2P0DMB1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRR23D2P0DMB1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRR23D2P0DMB1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRR23D2P0DMB1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRR23D2P0DMB1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRR23D2P0DMB1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRR23D2P0DMB1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRR23D2P0DMB1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRR23D2P0DMB1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRR23D2P0DMB1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRR23D2P0DMB1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRR23D2P0DMB1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRR23D2P0DMB1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR23D2P0DMB1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR23D2P0DMB1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRR23D2P0DMB1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR23D2P0DMB1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR23D2P0DMB1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR23D2P0DMB1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR23D2P0DMB1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR23D2P0DMB1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR23D2P0DMB1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRR23D2P0DMB1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRR23D2P0DMB1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRR23D2P0DMB1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR23D2P0DMB1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR23D2P0DMB1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRR23D2P0DMB1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRR23D2P0DMB1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRR23D2P0DMB1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRR23D2P0DMB1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRR23D2P0DMB1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23D2P0DMB1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23D2P0DMB1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23D2P0DMB1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23D2P0DMB1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23D2P0DMB1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR23D2P0DMB1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR23D2P0DMB1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR23D2P0DMB1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR23D2P0DMB1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRR23D2P0DMB1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRR23D2P0DMB1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRR23D2P0DMB1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRR23D2P0DMB1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRR23D2P0DMB1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRR23D2P0DMB1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRR23D2P0DMB1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRR23D2P0DMB1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRR23D2P0DMB1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRR23D2P0DMB1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRR23D2P0DMB1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRR23D2P0DMB1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRR23D2P0DMB1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRR23D2P0DMB1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRR23D2P0DMB1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR23D2P0DMB1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR23D2P0DMB1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRR23D2P0DMB1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRR23D2P0DMB1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRR23D2P0DMB1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRR23D2P0DMB1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRR23D2P0DMB1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRR23D2P0DMB1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRR23D2P0DMB1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRR23D2P0DMB1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRR23D2P0DMB1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRR23D2P0DMB1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRR23D2P0DMB1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRR23D2P0DMB1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRR23D2P0DMB1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRR23D2P0DMB1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRR23D2P0DMB1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRR23D2P0DMB1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRR23D2P0DMB1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRR23D2P0DMB1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRR23D2P0DMB1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRR23D2P0DMB1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRR23D2P0DMB1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRR23D2P0DMB1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRR23D2P0DMB1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRR23D2P0DMB1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRR23D2P0DMB1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRR23D2P0DMB1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRR23D2P0DMB1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRR23D2P0DMB1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRR23D2P0DMB1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRR23D2P0DMB1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRR23D2P0DMB1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRR23D2P0DMB1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRR23D2P0DMB1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRR23D2P0DMB1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRR23D2P0DMB1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRR23D2P0DMB1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRR23D2P0DMB1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRR23D2P0DMB1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRR23D2P0DMB1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRR23D2P0DMB1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRR23D2P0DMB1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRR23D2P0DMB1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms