Protein–RNA interactions for Protein: P08294

SOD3, Extracellular superoxide dismutase [Cu-Zn], humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD3P08294 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOD3P08294 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOD3P08294 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOD3P08294 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOD3P08294 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOD3P08294 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOD3P08294 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOD3P08294 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOD3P08294 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOD3P08294 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOD3P08294 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOD3P08294 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SOD3P08294 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOD3P08294 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOD3P08294 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOD3P08294 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOD3P08294 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOD3P08294 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOD3P08294 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SOD3P08294 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SOD3P08294 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOD3P08294 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOD3P08294 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOD3P08294 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOD3P08294 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOD3P08294 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOD3P08294 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOD3P08294 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOD3P08294 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOD3P08294 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOD3P08294 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOD3P08294 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOD3P08294 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOD3P08294 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOD3P08294 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SOD3P08294 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOD3P08294 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOD3P08294 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOD3P08294 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOD3P08294 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SOD3P08294 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOD3P08294 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOD3P08294 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOD3P08294 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOD3P08294 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOD3P08294 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOD3P08294 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SOD3P08294 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOD3P08294 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOD3P08294 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOD3P08294 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOD3P08294 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOD3P08294 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOD3P08294 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOD3P08294 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOD3P08294 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOD3P08294 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOD3P08294 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOD3P08294 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOD3P08294 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SOD3P08294 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOD3P08294 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOD3P08294 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SOD3P08294 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOD3P08294 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOD3P08294 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOD3P08294 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOD3P08294 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOD3P08294 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOD3P08294 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOD3P08294 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOD3P08294 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOD3P08294 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOD3P08294 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOD3P08294 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOD3P08294 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOD3P08294 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOD3P08294 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOD3P08294 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOD3P08294 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOD3P08294 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOD3P08294 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOD3P08294 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOD3P08294 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOD3P08294 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOD3P08294 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOD3P08294 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOD3P08294 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOD3P08294 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOD3P08294 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOD3P08294 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOD3P08294 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOD3P08294 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOD3P08294 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOD3P08294 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOD3P08294 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOD3P08294 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOD3P08294 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOD3P08294 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOD3P08294 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms