Protein–RNA interactions for Protein: P06028

GYPB, Glycophorin-B, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYPBP06028 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GYPBP06028 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GYPBP06028 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GYPBP06028 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GYPBP06028 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GYPBP06028 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GYPBP06028 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GYPBP06028 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GYPBP06028 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GYPBP06028 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GYPBP06028 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GYPBP06028 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GYPBP06028 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GYPBP06028 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GYPBP06028 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GYPBP06028 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GYPBP06028 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GYPBP06028 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GYPBP06028 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GYPBP06028 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GYPBP06028 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GYPBP06028 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GYPBP06028 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GYPBP06028 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GYPBP06028 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GYPBP06028 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GYPBP06028 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GYPBP06028 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GYPBP06028 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GYPBP06028 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GYPBP06028 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GYPBP06028 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GYPBP06028 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GYPBP06028 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GYPBP06028 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GYPBP06028 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GYPBP06028 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GYPBP06028 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GYPBP06028 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GYPBP06028 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GYPBP06028 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GYPBP06028 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GYPBP06028 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GYPBP06028 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GYPBP06028 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GYPBP06028 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GYPBP06028 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GYPBP06028 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GYPBP06028 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GYPBP06028 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GYPBP06028 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GYPBP06028 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GYPBP06028 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GYPBP06028 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GYPBP06028 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GYPBP06028 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GYPBP06028 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GYPBP06028 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GYPBP06028 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GYPBP06028 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GYPBP06028 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GYPBP06028 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GYPBP06028 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GYPBP06028 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GYPBP06028 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GYPBP06028 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GYPBP06028 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GYPBP06028 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GYPBP06028 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GYPBP06028 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GYPBP06028 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GYPBP06028 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GYPBP06028 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GYPBP06028 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GYPBP06028 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GYPBP06028 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GYPBP06028 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GYPBP06028 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GYPBP06028 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GYPBP06028 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GYPBP06028 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GYPBP06028 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GYPBP06028 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GYPBP06028 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GYPBP06028 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GYPBP06028 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GYPBP06028 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GYPBP06028 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GYPBP06028 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GYPBP06028 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GYPBP06028 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GYPBP06028 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYPBP06028 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYPBP06028 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYPBP06028 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYPBP06028 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GYPBP06028 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYPBP06028 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYPBP06028 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYPBP06028 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms