Protein–RNA interactions for Protein: P04234

CD3D, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3DP04234 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD3DP04234 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD3DP04234 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD3DP04234 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD3DP04234 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD3DP04234 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD3DP04234 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD3DP04234 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD3DP04234 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD3DP04234 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD3DP04234 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD3DP04234 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD3DP04234 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD3DP04234 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD3DP04234 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD3DP04234 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD3DP04234 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD3DP04234 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD3DP04234 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD3DP04234 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD3DP04234 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD3DP04234 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD3DP04234 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD3DP04234 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD3DP04234 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD3DP04234 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD3DP04234 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD3DP04234 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD3DP04234 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD3DP04234 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD3DP04234 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD3DP04234 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD3DP04234 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD3DP04234 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD3DP04234 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD3DP04234 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD3DP04234 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CD3DP04234 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD3DP04234 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD3DP04234 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD3DP04234 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD3DP04234 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD3DP04234 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD3DP04234 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD3DP04234 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD3DP04234 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD3DP04234 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD3DP04234 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD3DP04234 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD3DP04234 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD3DP04234 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD3DP04234 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CD3DP04234 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD3DP04234 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD3DP04234 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD3DP04234 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD3DP04234 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD3DP04234 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD3DP04234 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD3DP04234 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD3DP04234 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD3DP04234 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD3DP04234 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD3DP04234 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD3DP04234 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD3DP04234 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD3DP04234 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD3DP04234 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD3DP04234 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD3DP04234 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD3DP04234 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD3DP04234 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD3DP04234 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD3DP04234 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD3DP04234 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD3DP04234 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD3DP04234 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD3DP04234 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CD3DP04234 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD3DP04234 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD3DP04234 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CD3DP04234 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CD3DP04234 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD3DP04234 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD3DP04234 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD3DP04234 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD3DP04234 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD3DP04234 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD3DP04234 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD3DP04234 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD3DP04234 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD3DP04234 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD3DP04234 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD3DP04234 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD3DP04234 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD3DP04234 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD3DP04234 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD3DP04234 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD3DP04234 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD3DP04234 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms