Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-HP01893 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-HP01893 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-HP01893 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-HP01893 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-HP01893 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-HP01893 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-HP01893 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-HP01893 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-HP01893 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-HP01893 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-HP01893 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-HP01893 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-HP01893 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-HP01893 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-HP01893 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-HP01893 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-HP01893 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-HP01893 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-HP01893 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HLA-HP01893 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-HP01893 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-HP01893 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-HP01893 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-HP01893 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-HP01893 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-HP01893 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-HP01893 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-HP01893 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-HP01893 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-HP01893 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-HP01893 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-HP01893 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-HP01893 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-HP01893 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-HP01893 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-HP01893 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-HP01893 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-HP01893 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-HP01893 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-HP01893 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-HP01893 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-HP01893 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-HP01893 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-HP01893 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-HP01893 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-HP01893 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-HP01893 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-HP01893 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-HP01893 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-HP01893 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-HP01893 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-HP01893 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-HP01893 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-HP01893 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-HP01893 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-HP01893 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-HP01893 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-HP01893 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-HP01893 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-HP01893 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-HP01893 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-HP01893 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-HP01893 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-HP01893 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-HP01893 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HLA-HP01893 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
HLA-HP01893 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-HP01893 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-HP01893 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-HP01893 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-HP01893 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-HP01893 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-HP01893 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-HP01893 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms