Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-AP01891 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-AP01891 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-AP01891 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-AP01891 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-AP01891 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-AP01891 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-AP01891 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-AP01891 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-AP01891 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-AP01891 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-AP01891 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-AP01891 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-AP01891 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-AP01891 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-AP01891 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-AP01891 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-AP01891 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-AP01891 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-AP01891 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-AP01891 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-AP01891 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-AP01891 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-AP01891 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-AP01891 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-AP01891 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-AP01891 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-AP01891 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-AP01891 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-AP01891 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-AP01891 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-AP01891 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-AP01891 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-AP01891 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-AP01891 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-AP01891 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-AP01891 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-AP01891 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-AP01891 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-AP01891 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-AP01891 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-AP01891 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-AP01891 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-AP01891 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-AP01891 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-AP01891 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-AP01891 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-AP01891 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-AP01891 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-AP01891 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-AP01891 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-AP01891 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-AP01891 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-AP01891 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-AP01891 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-AP01891 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-AP01891 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-AP01891 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-AP01891 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-AP01891 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-AP01891 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-AP01891 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-AP01891 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-AP01891 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-AP01891 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-AP01891 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-AP01891 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-AP01891 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-AP01891 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-AP01891 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-AP01891 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-AP01891 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-AP01891 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-AP01891 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-AP01891 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HLA-AP01891 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-AP01891 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-AP01891 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-AP01891 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-AP01891 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-AP01891 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-AP01891 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-AP01891 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-AP01891 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-AP01891 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-AP01891 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-AP01891 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-AP01891 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-AP01891 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-AP01891 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-AP01891 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-AP01891 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-AP01891 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-AP01891 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-AP01891 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-AP01891 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-AP01891 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-AP01891 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-AP01891 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-AP01891 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms