Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STAMBPO95630 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STAMBPO95630 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STAMBPO95630 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STAMBPO95630 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STAMBPO95630 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STAMBPO95630 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STAMBPO95630 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STAMBPO95630 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STAMBPO95630 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STAMBPO95630 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STAMBPO95630 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
STAMBPO95630 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STAMBPO95630 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STAMBPO95630 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STAMBPO95630 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STAMBPO95630 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STAMBPO95630 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STAMBPO95630 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STAMBPO95630 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STAMBPO95630 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STAMBPO95630 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STAMBPO95630 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STAMBPO95630 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAMBPO95630 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAMBPO95630 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAMBPO95630 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAMBPO95630 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAMBPO95630 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAMBPO95630 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAMBPO95630 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAMBPO95630 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAMBPO95630 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAMBPO95630 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAMBPO95630 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STAMBPO95630 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STAMBPO95630 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STAMBPO95630 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STAMBPO95630 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAMBPO95630 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAMBPO95630 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAMBPO95630 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAMBPO95630 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAMBPO95630 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAMBPO95630 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STAMBPO95630 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAMBPO95630 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAMBPO95630 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
STAMBPO95630 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAMBPO95630 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAMBPO95630 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAMBPO95630 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAMBPO95630 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAMBPO95630 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAMBPO95630 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAMBPO95630 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAMBPO95630 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAMBPO95630 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAMBPO95630 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
STAMBPO95630 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAMBPO95630 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAMBPO95630 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STAMBPO95630 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STAMBPO95630 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STAMBPO95630 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STAMBPO95630 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STAMBPO95630 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAMBPO95630 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAMBPO95630 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAMBPO95630 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAMBPO95630 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAMBPO95630 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAMBPO95630 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAMBPO95630 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STAMBPO95630 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STAMBPO95630 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAMBPO95630 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAMBPO95630 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAMBPO95630 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAMBPO95630 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAMBPO95630 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAMBPO95630 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAMBPO95630 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAMBPO95630 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAMBPO95630 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAMBPO95630 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAMBPO95630 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAMBPO95630 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAMBPO95630 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAMBPO95630 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAMBPO95630 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAMBPO95630 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAMBPO95630 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAMBPO95630 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAMBPO95630 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAMBPO95630 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAMBPO95630 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAMBPO95630 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAMBPO95630 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAMBPO95630 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms