Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCELO95171 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCELO95171 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCELO95171 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCELO95171 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCELO95171 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCELO95171 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SCELO95171 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCELO95171 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCELO95171 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCELO95171 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCELO95171 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCELO95171 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCELO95171 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCELO95171 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCELO95171 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCELO95171 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCELO95171 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCELO95171 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCELO95171 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCELO95171 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCELO95171 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCELO95171 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCELO95171 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCELO95171 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCELO95171 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCELO95171 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCELO95171 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCELO95171 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SCELO95171 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCELO95171 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCELO95171 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCELO95171 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCELO95171 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCELO95171 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCELO95171 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCELO95171 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCELO95171 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCELO95171 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCELO95171 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCELO95171 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCELO95171 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCELO95171 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCELO95171 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCELO95171 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCELO95171 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCELO95171 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCELO95171 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCELO95171 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCELO95171 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCELO95171 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCELO95171 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCELO95171 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCELO95171 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCELO95171 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCELO95171 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCELO95171 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCELO95171 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCELO95171 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCELO95171 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCELO95171 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCELO95171 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCELO95171 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCELO95171 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCELO95171 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCELO95171 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCELO95171 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCELO95171 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCELO95171 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCELO95171 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCELO95171 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCELO95171 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCELO95171 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCELO95171 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCELO95171 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCELO95171 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SCELO95171 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCELO95171 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCELO95171 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCELO95171 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCELO95171 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCELO95171 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCELO95171 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCELO95171 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCELO95171 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCELO95171 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCELO95171 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCELO95171 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCELO95171 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCELO95171 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCELO95171 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCELO95171 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCELO95171 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCELO95171 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCELO95171 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCELO95171 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCELO95171 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCELO95171 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCELO95171 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCELO95171 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms