Protein–RNA interactions for Protein: O95164

UBL3, Ubiquitin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL3O95164 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBL3O95164 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBL3O95164 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBL3O95164 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBL3O95164 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBL3O95164 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBL3O95164 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UBL3O95164 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBL3O95164 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBL3O95164 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBL3O95164 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBL3O95164 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBL3O95164 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBL3O95164 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBL3O95164 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBL3O95164 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBL3O95164 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBL3O95164 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBL3O95164 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBL3O95164 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBL3O95164 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBL3O95164 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
UBL3O95164 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBL3O95164 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBL3O95164 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBL3O95164 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBL3O95164 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBL3O95164 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBL3O95164 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBL3O95164 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBL3O95164 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBL3O95164 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBL3O95164 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UBL3O95164 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBL3O95164 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBL3O95164 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBL3O95164 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBL3O95164 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBL3O95164 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBL3O95164 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBL3O95164 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBL3O95164 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBL3O95164 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBL3O95164 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBL3O95164 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBL3O95164 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBL3O95164 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBL3O95164 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBL3O95164 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBL3O95164 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBL3O95164 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBL3O95164 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBL3O95164 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBL3O95164 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBL3O95164 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBL3O95164 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBL3O95164 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
UBL3O95164 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBL3O95164 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBL3O95164 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBL3O95164 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBL3O95164 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBL3O95164 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBL3O95164 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBL3O95164 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBL3O95164 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBL3O95164 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBL3O95164 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBL3O95164 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBL3O95164 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBL3O95164 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBL3O95164 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBL3O95164 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBL3O95164 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBL3O95164 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBL3O95164 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBL3O95164 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBL3O95164 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBL3O95164 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBL3O95164 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBL3O95164 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBL3O95164 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBL3O95164 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBL3O95164 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBL3O95164 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBL3O95164 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBL3O95164 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBL3O95164 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBL3O95164 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBL3O95164 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBL3O95164 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBL3O95164 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBL3O95164 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBL3O95164 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBL3O95164 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBL3O95164 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBL3O95164 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBL3O95164 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBL3O95164 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBL3O95164 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms